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This page contains selected news from the lab, popular science articles, media releases as well as a list of the most recent additions, changes on our website and in the ReskiLab. Please also look at our publications and patents.

17 April 2019 · Grundlagenforschung

Neues Bioinformatik-Zentrum BioDATEN

Das ReskiLab ist Mitglied des neu genehmigten Forschungsdatenzentrums BioDATEN, das primäre Forschungsdaten besser nutzbar machen wird. Denn die alleinige Sicherung von Primärdaten reicht heutzutage nicht mehr aus, um die Wissenschaft voranzubringen. ReskiLab wird hier seine Expertise in der vergleichenden Genomik und Systembiologie der Moose einbringen. Im Projekt BioDATEN (Bioinformatics DATa Environment) sind Arbeitsgruppen der Universitäten Tübingen, Freiburg, Heidelberg, des Deutschen Krebsforschungszentrums (DKFZ) und des European Molecular Biology Laboratory (EMBL) zusammengeschlossen. Diese sollen an den Bioinformatik-Standorten Baden-Württembergs ein multiinstitutionelles Datenzentrum für die lebenswissenschaftliche Forschung aufbauen. Das Zentrum wird bioinformatische Workflows über den gesamten Lebenszyklus der Daten unterstützen. Das erleichtert den Nutzerinnen und Nutzern den Zugang zu verschiedenen voneinander unabhängigen Infrastrukturen auf regionaler, nationaler und internationaler Ebene, u.a. die baden-württembergische Hochleistungsrechnen-Infrastruktur (HPC), das deutsche Netzwerk für Bioinformatik-Infrastruktur de.NBI (www.denbi.de), das europäische Bioinformatik-Netzwerk ELIXIR (www.elixir-europe.org) und das internationale Bioinformatik-Netzwerk Galaxy (www.galaxyproject.org). Das Zentrum erhält dazu 2,5 Millionen Euro von der Landesregierung Baden-Württembergs.

Quelle: Ministerium für Wissenschaft, Forschung und Kunst Baden-Württemberg

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11 April 2019 · In the Media

Regeneration of moss cells depends on their position

ScienceDaily reported about our development of a new single-cell RNA sequencing technology, single cell-digital gene expression that is able to measure the transcriptome while preserving the positional information of the cell in the tissue. Together with our colleagues from Japan we validated this technology in the moss Physcomitrella patens by measuring how the location of a cell in a leaf influences its properties for cellular reprogramming. First author Minoru Kubo has invented the described method of microcapillary manipulation in the ReskiLab before he went back to Japan. We published these results open access in the journal Nucleic Acids Research (DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkz181).

Source: ScienceDaily

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22 January 2019 · In the Media

Peat moss devices monitor polystyrene plastic pollution

A recent article that appeared in Botany One highlights that our Italian colleagues in the EU FP7-funded MOSSclone project have shown that the invented device containing peat moss Sphagnum palustre is also capable to monitor plastic pollution - besides air pollution for which we invented this tool in the first place. In the Italian study, polystyrene nanoparticles entrapped in the devices increased with increasing exposure time, which means that this is a suitable measuring method. The used devitalized S. palustre material was even better at retaining nanoparticles than living material. Moreover, the production of this measuring material is sustainable, since we produced the mosses from clones in bioreactors.

Source: Botany One

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